Компания "ФГБУ ЦСП ФМБА России"
Центр постгеномных технологий приглашает научного сотрудника-биоинформатика, с уверенным владением Python, опытом в написании научных статей и желанием их писать, а также опытом самостоятельной работы.
Обязанности:
- Основные задачи - в области геномики патогенных микроорганизмов, научная работа.
- Разработка биоинформатических пайплайнов для автоматизации задач по обработке данных секвенирования.
- Сборка и обработка референсных баз данных геномных последовательностей.
- Подбор и тестирование праймерных последовательностей.
- Представление результатов в виде научных статей, написание научных статей.
- Составление отчётной документации.
- Участие в разработке универсальных скрининговых систем.
Требования:
- высшее образование профильное либо в смежной области (биология, молекулярная биология, биотехнология, биоинформатика, генетика и т.п.).
- Опыт написания научных статей - обязательно и желание их писать.
- Опыт обработки данных высокопроизводительного секвенирования.
- Опыт работы с вычислительными кластерами (unix, bash, slurm).
- Плюсом будет опыт работы в молекулярно-генетической лаборатории
- Уверенное владение python:
- Владение biopython
- Владение библиотеками для статистической обработки и визуализации данных (pandas, numpy, matplotlib).
- Знание синтаксиса SQL.
- Умение работать с вычислительными кластерами (unix, bash, slurm)
- Опыт работы с программными пакетами для:
- картирования прочтений и аннотации вариантов нуклеотидной последовательности (bwa, Samtools, bcftools, GATK);
- алгоритмов поиска и таксономической классификации.
- Навыки быстрого анализа литературных данных.
- Преимуществом будет владение программными пакетами для:
- сборки геномов de novo
- сборки геномов по референсу
- алгоритмов поиска и таксономической классификации
- построения попарных и множественных выравниваний последовательностей
- проведения филогенетического анализа.
Условия:
- оформление по ТК РФ.
- Своевременная выплата заработной платы.
- В начале работы (2-3 месяца) - присутствие в лаборатории каждый день по пятидневной рабочей неделе (время прихода и ухода с работы - по договоренности с непосредственным руководителем) с целью полного погружения в тему и работу лаборатории, далее можно рассмотреть режим работы - 2-3 дня присутственные дни, остальное время - дистанционно (по договоренности с непосредственным руководителем).
- Возможность прикрепления к ведомственной поликлинике.
- Возможность участвовать в научных конференциях, семинарах и обучающих программах.
- Размер заработной платы обсуждается индивидуально, зависит от знаний, опыта, навыков.
- Возможность профессионального роста.
- Современная лаборатория с хорошим оборудованием.
- Научные исследования имеют научно-прикладной характер.